Clasificacion de las proteinas

proteína de transporte de membrana

Representación de la estructura tridimensional de la proteína mioglobina que muestra las α-hélices de color turquesa. Esta proteína fue la primera en tener su estructura resuelta por cristalografía de rayos X. Hacia el centro de la derecha, entre las espirales, un grupo prostético llamado grupo hemo (mostrado en gris) con una molécula de oxígeno unida (rojo).
Las proteínas son grandes biomoléculas y macromoléculas que comprenden una o más cadenas largas de residuos de aminoácidos. Las proteínas desempeñan un amplio abanico de funciones en los organismos, como catalizar reacciones metabólicas, replicar el ADN, responder a estímulos, estructurar las células y los organismos y transportar moléculas de un lugar a otro. Las proteínas se diferencian entre sí principalmente por su secuencia de aminoácidos, que viene dictada por la secuencia de nucleótidos de sus genes, y que suele dar lugar a que la proteína se pliegue en una estructura tridimensional específica que determina su actividad.
Una cadena lineal de residuos de aminoácidos se denomina polipéptido. Una proteína contiene al menos un polipéptido largo. Los polipéptidos cortos, que contienen menos de 20-30 residuos, rara vez se consideran proteínas y se denominan comúnmente péptidos, o a veces oligopéptidos. Los residuos de aminoácidos individuales están unidos por enlaces peptídicos y residuos de aminoácidos adyacentes. La secuencia de residuos de aminoácidos en una proteína está definida por la secuencia de un gen, que está codificada en el código genético. En general, el código genético especifica 20 aminoácidos estándar; pero en ciertos organismos el código genético puede incluir selenocisteína y -en ciertas arqueas- pirrolisina. Poco después, o incluso durante la síntesis, los residuos de una proteína suelen ser modificados químicamente por medio de modificaciones postraduccionales, que alteran las propiedades físicas y químicas, el plegamiento, la estabilidad, la actividad y, en última instancia, la función de las proteínas. Algunas proteínas tienen unidos grupos no peptídicos, que pueden denominarse grupos prostéticos o cofactores. Las proteínas también pueden trabajar juntas para lograr una función determinada, y a menudo se asocian para formar complejos proteicos estables.

clasificación de las proteínas pdf

ResumenDescribimos aquí PRODISTIN, un nuevo método computacional que permite la agrupación funcional de proteínas sobre la base de datos de interacción proteína-proteína. Este método, evaluado biológica y estadísticamente, nos permitió clasificar el 11% del proteoma de Saccharomyces cerevisiae en varios grupos, la mayoría de los cuales contenían proteínas implicadas en el mismo proceso(s) biológico(s), y predecir una función celular para muchas proteínas que de otro modo no estarían caracterizadas.
Genome Biol 5, R6 (2003). https://doi.org/10.1186/gb-2003-5-1-r6Download citationShare this articleAnyone you share the following link with will be able to read this content:Get shareable linkSorry, a shareable link is not currently available for this article.Copy to clipboard

clasificación de las proteínas slideshare

ResumenPara clasificar cuantitativamente las estructuras de las proteínas, desarrollamos un modelo cuantitativo de grano grueso de las estructuras de las proteínas con una nueva red de aminoácidos, la red selectiva de interacción (ISN), caracterizada por los enlaces basados en las interacciones tanto en las cadenas principales como en las laterales. Descubrimos que la ISN es un nuevo modelo de red robusto que muestra una mayor probabilidad de clasificación en los gráficos del grado medio de los vértices (k) frente al coeficiente medio de agrupación (C), ambos parámetros típicos de las redes de las estructuras proteicas, y distingue con éxito entre las proteínas «all-α» y «all-β». Por otro lado, una de las redes convencionales típicas, la red α-carbono (CAN), resultó ser menos robusta que la ISN, y otra red típica, la red de distancia atómica (ADN), no logró distinguir entre estas dos estructuras proteicas. Teniendo en cuenta que los enlaces en la CAN y la ADN se definen por las interacciones sólo entre los átomos de la cadena principal y por la distancia del par de átomos más cercano entre los dos residuos de aminoácidos, respectivamente, podemos concluir que reflejar la información estructural de las estructuras secundarias y terciarias en los parámetros de la red mejora la evaluación cuantitativa y la robustez en los modelos de red, lo que resulta en una descripción cuantitativa y más robusta de las estructuras tridimensionales de las proteínas en la ISN.

clasificación de las proteínas con ejemplos

Se han propuesto diferentes métodos de clasificación de proteínas, pero actualmente ninguno de ellos es universalmente válido. A continuación, algunos ejemplos basados en la composición química, la estructura, las funciones y la solubilidad en diferentes disolventes.
Estas proteínas son insolubles en agua, ya que contienen, tanto internamente como en su superficie, muchos aminoácidos hidrofóbicos. La presencia en su superficie de aminoácidos hidrofóbicos facilita su empaquetamiento en estructuras supramoleculares muy complejas.
Tienen una estructura compacta y más o menos esférica, más compleja que las proteínas fibrosas. En este sentido, se encuentran motivos, dominios, estructuras terciarias y cuaternarias, además de las estructuras secundarias.
La multitud de funciones que desempeñan las proteínas es consecuencia tanto del plegamiento de la cadena polipeptídica, por tanto de su estructura tridimensional, como de la presencia de muchos grupos funcionales diferentes en las cadenas laterales de los aminoácidos, como tioles, alcoholes, tioéteres, carboxamidas, ácidos carboxílicos y diferentes grupos básicos.

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